云南大学档案馆（校史馆、历史博物馆）承担着全校档案管理、党史校史研究、校园历史文化传播的工作职能，业务上接受云南省档案局、云南省教育厅的指导、监督与检查，是统筹、协调、管理全校档案管理、党史校史研究工作的职能机构，也是面向全校师生、社会公众提供档案信息查询、历史文化服务的服务保障机构。

云南大学档案工作可追溯至20世纪60年代设立的云南大学校长办公室档案室。随着办学规模扩大和管理规范化需求提升，学校档案工作体系不断健全完善。学校于1992年正式成立档案馆，为正处级单位。1995年成立云南大学档案工作管理委员会，由分管档案工作校领导担任主任，相关职能部门负责人为成员，统筹协调全校档案工作的规划与实施。1999年2月，原云南政法高等专科学校档案科并入档案馆；2005年12月，学校党史校史研究室并入档案馆，更名为档案馆·党史校史研究室，初步形成档案管理与校史研究协同发展的工作格局。2025年12月，经学校研究决定，将历史博物馆、校园文物管理职能划入档案馆，成立云南大学档案馆（校史馆、历史博物馆）。至此，云南大学档案馆（校史馆、历史博物馆）的职能定位更加清晰，不仅是学校档案管理的核心机构，更是传承学校精神文脉、弘扬历史文化的重要窗口。

面向未来，云南大学档案馆（校史馆、历史博物馆）将以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，深入学习贯彻习近平总书记对档案工作“四个好”“两个服务”“三个走向”的重要指示批示精神，紧紧围绕学校中心工作，强化档案资源体系、治理体系、利用体系、安全体系建设，推动“档案+校史+文物”融合发展，深入挖掘校史文化中的育人元素和学术价值，为学校“双一流”建设和高质量发展贡献力量。